Podatnik decydujący się na kwartalne rozliczanie deklaracji VAT, zobowiązany jest do zapłaty podatku do 25 dnia miesiąca następującego po zakończonym kwartale. Ta metoda rozliczania nie modyfikuje pod żadnym względem zasad co do rozliczenia zobowiązania podatkowego.
Kwartalne rozliczanie jest atrakcyjne w momencie, gdy u przedsiębiorcy występuje zazwyczaj „podatek VAT do zapłaty”. W tej sytuacji przedsiębiorca ma możliwość przesunięcia opłaty zobowiązania podatku do 25 dnia po rozliczanym kwartale. Jednakże w sytuacji gdy kwota podatku VAT do zapłaty jest znacząca, wybór tej metody może okazać się złym wyborem, ponieważ zapłata jednorazowo znaczących kwot zobowiązania podatkowego, może znacząco osłabić płynność finansową przedsiębiorstwa.
Dodatkowo warto rozważyć kolejny czynnik nie opłacalnego kwartalnego rozliczania podatku VAT, podatnicy u których wstępuje zazwyczaj „podatek VAT do przeniesienia” , w momencie wystąpienia do Urzędu Skarbowego o zwrot nadpłaconego podatku VAT w deklaracji kwartalnej, czas oczekiwania na realizacje zwrotu jest dłuższy.
Powrót z rozliczeń VAT kwartalnych na rozliczenia miesięczne jest możliwe lecz, nie wcześniej niż po upływie 4 kwartałów, wymagane jest również złożenia zawiadomienia dp naczelnika swojego Urzędu Skarbowego, najpóźniej z upływem terminu złożenia pierwszej deklaracji za okres miesięczny.